在我国和日本家族性发病很少见，因此，在我国的溃疡性结肠炎病因中遗传因素不占重要地位。但在欧美本病的家族发病率较高，5%~15%的溃疡性结肠炎患者亲属也有本病史，其同种白细胞抗原B11（HLA–B11）、B7(HLA–B7)的发生率高，与某些HLA的关联等均提示存在遗传因素。种族间的发病率有明显差异，犹太人的发病率为非犹太人的3.5倍，发病年龄亦远较一般人为低，被认为与遗传因素有关。